City: Test Saint Petersburg Novosibirsk Kazan Language: Русский English

Computer Science meets Immunology, или как вычислительные задачи помогают анализировать болезни (Я. Сафонова)
Seminar on Computer Science

What: Lecture
When: Sunday, 25 October 2020, 23:00–00:30
Where: Конференция в zoom, Онлайн
Slides: csseminar_lecture_251020.pdf

Description

Адаптивная иммунная система позволяет организму приобретать защиту от разнообразных патогенов и сохранять ее при повторных заболеваниях. Основная сложность изучения адаптивного иммунитета связана с тем, что основные его агенты не закодированы в геноме напрямую, а являются результатом соматической рекомбинации генов. Такая рекомбинация не только обеспечивает максимальное разнообразие иммунных рецепторов, но и делает иммунный ответ уникальным для каждого человека.

Развитие технологий секвенирования ДНК позволило сканировать индивидуальные наборы иммунных рецепторов, что, в свою очередь, вызвало необходимость разработки вычислительных методов для обработки данных иммуносеквенирования. Недавние исследования показали эффективность использования таких данных при анализе предрасположенности к заболеваниям, оценке эффективности вакцин и разработке лекарств. Благодаря этим достижениям иммуноинформатика стала одним из самых приоритетных направлений в персональной медицине.

В лекции мы рассмотрим базовые вычислительные задачи, связанные с анализом данных иммуносеквенирования, и обсудим их приложения в медицине и фармацевтике.

Video